1件の配置先のみ消費税率が変更される前に集計されていた事が原因です。
メインメニュー⇒マスタ管理⇒自社マスタ画面で消費税率が正常に変更されている事を確認して下さい。
正しい消費税率に変更されている事を確認できましたら、
再度請求集計を行って頂くと、正常な消費税率で集計されるようになります。